
帕妥珠单抗蚁集曲妥珠单抗(P+T)这一靶向HER2的双抗体蚁集决策,在HER2阳性结直肠癌中展现出抗肿瘤活性。液体活检在肿瘤临床诊疗中的哄骗日益粗莽,但肿瘤组织与轮回肿瘤DNA(ctDNA)中ERBB2景象的联系性,以及通过ctDNA监测已矣诊治早期疗效评估和耐药性检测的价值,目下尚未明确。MyPathway磨真金不怕火中,85例ERBB2扩增和/或过抒发的结直肠癌患者接受了P+T决策诊治;其中42例患者在诊治第1周期第1天(C1D1)进行ctDNA检测,38例患者完成了血浆ctDNA的纵向检测。本筹商分析了ctDNA与肿瘤组织中ERBB2景象的一致性、基因组共突变特征、ctDNA的动态变化规定过火与诊疗养效的联系性。
42例患者中,41例(98%)在C1D1的ctDNA中检测到基因组变异,29例(69%)检测到ERBB2扩增。肿瘤组织下一代测序(NGS)检测的ERBB2拷贝数与C1D1 ctDNA中ERBB2拷贝数呈强有关。37%的患者在诊治第3周期第1天(C3D1)时达到分子学缓解,且该闭幕与患者PFS(PFS)和总生活期(OS)延迟显贵有关。CDKN2A和KRAS突变与患者OS裁减有关,PIK3CA突变也表现出不异的趋势。患者疾病发达时,ctDNA中检测到多种新发共突变,波及MAPK、PI3K信号通途经火他酪氨酸受体激酶。
对于肿瘤组织中检测到ERBB2扩增的结直肠癌患者,ctDNA可在大部分患者中检测到该扩增,但并非一都。ctDNA分子学缓解与患者更佳的生活预后有关,而ctDNA中的基因组共突变特征,或可为揭示结直肠癌对P+T决策的原发性和赢得性耐药机制提供痕迹。
伸开剩余92%筹商布景
HER2/ERBB2扩增和/或过抒发在系数实体肿瘤中的发生率为2%~3%,在结直肠癌中为3%~5.8%。HER2已成为转化性结直肠癌中告诫证的诊治靶点,好意思国食物药品监督不停局(FDA)近期已批准多款靶向药物用于该类患者,包括图卡替尼蚁集曲妥珠单抗、德曲妥珠单抗,同期好意思国国度笼统癌症相聚(NCCN)肿瘤临床实行指南也将帕妥珠单抗蚁集曲妥珠单抗(P+T)、拉帕替尼蚁集曲妥珠单抗纳入保举决策。MyPathway磨真金不怕火(NCT02091141)表现,P+T决策在HER2阳性、KRAS野生型结直肠癌患者中的客不雅缓解率(ORR)达33%;好意思国临床肿瘤学会(ASCO)开展的TAPUR磨真金不怕火也证实了P+T决策的抗肿瘤活性,其在ERBB2扩增型结直肠癌中的客不雅缓解率为25%。尽管HER2是结直肠癌中明确的可靶向诊治靶点,但对于结直肠癌对HER2靶向诊治产生原发性和赢得性耐药机制的筹商仍相配有限。
血浆ctDNA的基因组变异检测,现已成为精确肿瘤学中的紧迫器用。大都筹商证实,通过ctDNA检测可识别突变、拷贝数变异及部分交融基因等可靶向诊治的靶点,进而为诊治决策提供依据。此外,纵向相聚血浆样本不仅可用于诊治流程中肿瘤负荷的药效学监测,还能检测与胃肠说念肿瘤赢得性耐药有关的新发突变。
本筹商基于MyPathway磨真金不怕火中留存有血浆样本、可进行ctDNA分析的ERBB2扩增和/或过抒发结直肠癌患者部队,计议液体活检在该类患者中的哄骗价值。筹商方针包括:(1)分析诊治前ctDNA检测闭幕与肿瘤组织检测闭幕的联系性;(2)分析ctDNA的动态变化与基于RECIST 1.1圭臬评估的诊疗养效及患者生活的联系性;(3)评估共存基因组变异对诊疗养效的影响;(4)筛选患者疾病发达时出现的新发基因变异。
筹商轨范
MyPathway磨真金不怕火(NCT02091141)是一项洞开标签、非立地、多中心、多篮字的2a期临床磨真金不怕火,包含结直肠癌患者部队。本筹商纳入的HER2篮子磨真金不怕火结直肠癌部队患者,其肿瘤均存在ERBB2扩增和/或HER2过抒发。患者接受静脉输注帕妥珠单抗(负荷剂量840mg,后续每3周420mg)蚁集曲妥珠单抗(负荷剂量8mg/kg,后续每3周6mg/kg)诊治,直至疾病发达或出现不可耐受的毒性。肿瘤疗效由筹商者字据RECIST v1.1圭臬评估,基线时完成初度评估,前24周每2个诊治周期评估一次,尔后每4个周期评估一次。
MyPathway磨真金不怕火中ERBB2扩增/HER2过抒发部队的患者入组,依据经临床实验室转变修正案(CLIA)认证的实验室检测闭幕,证据其归档或簇新肿瘤组织样本存在HER2变异。其中,HER2过抒发界说为免疫组化(IHC)检测3+染色;ERBB2扩增的判定依据包括荧光原位杂交/显色原位杂交(FISH/CISH,ERBB2/CEP17比值>2.0或ERBB2拷贝数>6.0)、下一代测序(NGS,存在职意拷贝数增多即判定为扩增)和/或团聚酶链反映(PCR)或Sanger测序(检测到ERBB2扩增或突变)。入组时需上报腹地检测领受的技巧平台、HER2景象过火他分子变异(如KRAS突变)。
在2017年磨真金不怕火决策3版发布前,相聚血液进行ctDNA分析是MyPathway磨真金不怕火的可选筹商履行。对于签署知情本旨的患者,分别在诊治前(C1D1)、诊治时代(C3D1)和肿瘤发达时相聚血浆样本。血浆样本由精确健康公司领受Guardant360检测平台完成ctDNA测序分析,检测轨范同既往筹商报说念。
将C1D1的ctDNA检测闭幕与归档肿瘤组织的检测闭幕进行对比;将诊治流程中ctDNA的变化与基于圭臬RECIST圭臬评估的诊疗养效进行联系分析;对比C1D1时ctDNA与肿瘤组织检测到的共存分子变异;评估共突变对P+T决策诊疗养效的影响,以及肿瘤发达时ctDNA中检测到的新发共突变。
筹商闭幕
MyPathway磨真金不怕火的HER2部队中共入组346例经决策证据存在HER2分子变异的患者,基于腹地肿瘤检测闭幕,其中85例为ERBB2扩增和/或过抒发的结直肠癌患者。磨真金不怕火后期对决策进行了转变,新增了纵向ctDNA样本的相聚条目。本筹商重心分析42例接受P+T决策诊治、且基线时完成血浆ctDNA检测的HER2扩增和/或过抒发结直肠癌患者,其中37例患者留存有C3D1样本,13例留存有诊治收尾(EOT)样本。若样本相聚于疾病发达(PD)后4周内,则归为发达期样本。患者基线至诊治收尾的平均时候为5.7个月±9.7个月,平均诊治周期为9.2个±13.8个。
ctDNA中基因组变异的检测及肿瘤负荷的评估:
42例患者中,41例(98%)在C1D1的ctDNA中检测到基因组变异。图1A展示了血浆部队中基线平均VAF的分散边界。患者用于检测的血浆样本平均体积为2.9mL,边界为1.8~5mL;在此体积边界内,提真金不怕火的ctDNA量与血浆上样体积无有关性。但如图1B所示,平均VAF与ctDNA上样量呈显贵正有关(R=0.41,P=0.007),因此本筹商臆想,基线ctDNA量和平均VAF均可算作肿瘤负荷的替代方针。为考据肿瘤负荷是否影响ctDNA的检测闭幕,本筹商登第诊治运转时腹地检测的癌胚抗原(CEA)水平算作肿瘤负荷的临床象征物进行分析。26例患者留存有CEA检测数据,其水平与基线平均VAF呈显贵正有关(R=0.45,P=0.02),领导平均VAF与肿瘤负荷存在联系(图1C)。
图1
本筹商进一步分析了ctDNA的VAF与诊疗养效的联系性。按最好总体疗效(BOR)分层(疾病发达/病情厚实/部分缓解),各组患者的平均VAF无统计学互异(图2A)。但以基线平均VAF的中位数为界进行分组,低平均VAF组患者的PFS显贵更长(HR=0.45,95%CI:0.23~0.88,P=0.016,图2B),OS也显贵更长(HR=0.27,95%CI:0.12~2.58,P<0.001,图2C)。
图2
随后本筹商分析了ctDNA中ERBB2扩增的检测情况,42例患者中29例(69%)在C1D1的ctDNA中检测到ERBB2扩增(图1D)。ctDNA中检测到ERBB2扩增的患者,其平均VAF显贵高于未检测到ERBB2变异的患者(图1E),领导ERBB2扩增未被检测到,至少部分原因是肿瘤细胞开释的ctDNA量较低。13例基线时未检测到ERBB2扩增的患者中,3例检测到其他拷贝数变异,领导这3例为真阴性闭幕。本筹商发现ERBB2景象与NGS、ISH检测闭幕存在联系,ctDNA C1D1中ERBB2拷贝数与ISH检测的ERBB2拷贝数(R=0.73,P<0.001)、肿瘤组织NGS检测的ERBB2拷贝数(R=0.84,P<0.001)均呈显贵有关。C1D1 ctDNA中ERBB2扩增的检测闭幕与肿瘤学预后无联系。图3A展示了系列样本ctDNA分析中ERBB2扩增的检测情况,29例C1D1 ctDNA检测到ERBB2扩增的患者中,3例在C3D1时未检测到扩增,其中2例为部分缓解(PR)、1例为病情厚实(SD);2例最好总体疗效为病情厚实的患者,其ctDNA中冉冉检测出ERBB2扩增。13例留存有诊治收尾样本的患者,其ctDNA中均检测到ERBB2扩增,其中2例在C1D1时未检测到该扩增。
图3
分子学缓解与患者预后:
本筹商领受倍数变化法和百分比变化法两种样子,分析了ctDNA分子特征的动态变化,过火与诊疗养效、患者生活预后的联系性。
以基线至C3D1平均VAF编造2倍算作分子学缓解的圭臬(图3B),13例(37%)患者的平均VAF编造2倍以上,4例(11%)升高2倍以上,18例(51%)无显明变化(图3B)。该分子学缓解特征与最好总体疗效有关,系数ctDNA VAF编造的患者,其最好总体疗效均为病情厚实或部分缓解;7例部分缓解患者中,5例达到分子学缓解(图3C)。若C3D1样本相聚于疾病发达后4周内,则将其归为发达期样本,分析发现,C3D1后4周内发生疾病发达的患者均未达到分子学缓解,而未发生疾病发达的患者中48%达到分子学缓解(图3D)。
从C1D1至C3D1达到ctDNA分子学缓解(平均VAF编造2倍)的患者,其PFS更长(HR=0.30,95%CI:0.14~0.63,P=0.001),OS也更长(HR=0.39,95%CI:0.16~0.94,P=0.028,图3E)。
本筹商同期依据Zhang等东说念主建议的圭臬评估ctDNA分子学缓解,将平均VAF编造至少50%的患者界说为分子学缓解者。按该圭臬评估,赢得分子学缓解的患者比例与前述轨范支配,33例患者中12例(38%)为分子学缓解者,14例(44%)为非缓解者,6例(19%)为ctDNA低水平者。该轨范中,ctDNA低水平指ctDNA水平过低,无法准确量化其变化百分比;既往筹商表现,ctDNA低水平的患者预后频繁优于高水平患者,本筹商部队中该类患者的PFS和OS也均更优,但未达到统计学兴致。从C1D1至C3D1达到分子学缓解的患者,其PFS显贵长于未缓解者(HR=0.05,95%CI:0.01~0.30,P<0.001),但二者的OS无显贵联系。
ctDNA中其他基因组变异的检测:
{jz:field.toptypename/}本筹商分析了C1D1 ctDNA的基因组特征,以筛选是否存在其他致癌驱动基因,及该时候点的ctDNA共突变是否与诊疗养效有关。如图4A所示,最常见的其他变异基因为TP53(83%)、APC(64%)、PIK3CA(33%)、EGFR(31%)、BRAF(45%)和KRAS(21%)。部分患者还检测到潜在可靶向诊治靶点的变异,包括FGFR1和FGFR2的突变或扩增、MET基因变异及ATM突变。
图4
7例最好总体疗效为部分缓解的患者中,6例在ctDNA中检测到ERBB2扩增,1例同期检测到ERBB2的激活突变G776V;仅1例缓解患者检测到PIK3CA变异,无患者检测到KRAS或CDKN2A突变。
本筹商进一步分析了C1D1时基因组共突变与患者OS的联系性。3例患者检测到CDKN2A突变,且均发生疾病发达(图4B),其OS显贵裁减(HR=9.04,95%CI:2.1~38.3,澳门威斯人P<0.001,图4C)。既往肿瘤组织检测筹商已证实,KRAS突变与患者预后不良有关。本ctDNA亚组筹商中,42例患者中9例在C1D1的ctDNA中检测到KRAS突变(图4B),且该突变与患者OS显贵裁减有关(HR=2.3,95%CI:1.0~5.2,P=0.048,图4C)。7例患者检测到PIK3CA突变,5例检测到PIK3CA扩增,另有2例同期检测到该基因的突变和扩增;捎带PIK3CA变异的患者,其OS也呈裁减趋势(HR=2.1,95%CI:1.0~4.5,P=0.06)。
HER2靶向诊治后的赢得性基因变异:
本筹商对21例同期留存有C1D1和疾病发达样本的患者进行ctDNA变化分析,其中8例患者的C3D1样本归为发达期样本(图4D)。本筹商将“赢得性变异”界说为:疾病发达样本中检测到,但归档肿瘤组织的NGS分析及C1D1 ctDNA检测中均未发现的变异。值得提防的是,21例患者中4例(19%)检测到ERBB2单核苷酸变异,其中2例为未知致癌性的ERBB2变异(HER2 V505L和HER2 R487W),1例为已知致癌性的ERBB2突变(HER2 S310F),1例同期检测到两个ERBB2单核苷酸变异(HER2 N530T和HER2 V356G),并在致癌热门区域检测到一个低频的HER2插入缺失突变A775_G776insYVMA。21例患者中6例(28.6%)在疾病发达时出现MAPK通路变异,其中5例出现激活型KRAS突变,2例同期并吞其他MAPK通路的协同变异。
此外,患者还出现了其他酪氨酸受体激酶的赢得性变异。值得和蔼的是,21例患者中6例(29%)检测到MET基因变异,其中4例在疾病发达时出现MET扩增,且3例的最好总体疗效为疾病发达;2例检测到MET单核苷酸变异,1例为已知的激活型突变(MET Y1003F)。同期,4例患者检测到FGFR1/2/3基因变异,包括2例FGFR1扩增、1例FGFR3交融和1例FGFR2单核苷酸变异(K367M,兴致未明)。此外,6例(28.6%)患者出现PI3K通路的赢得性变异,包括激活型PIK3CA突变(M1043I)、PIK3CA扩增及失活型PTEN突变(N94fs)。
讨 论
HER2已成为HER2阳性转化性结直肠癌的紧迫诊治靶点。MyPathway磨真金不怕火中,已证实P+T决策的抗肿瘤活性,该决策也因此被纳入欧洲肿瘤内科学会(ESMO)和NCCN的临床实行指南。本筹商进一步发现,肿瘤组织中检测到ERBB2扩增的结直肠癌患者,其ctDNA中大部分可检测到该扩增,但ctDNA中ERBB2的检测闭幕至少部分与肿瘤负荷有关。通过至少一种评估轨范证实,ctDNA中低VAF及ctDNA对诊治的应酬均与患者PFS和OS延迟有关。
ctDNA在结直肠癌诊疗中的哄骗受到越来越多的和蔼,其可用于细小残留病灶的评估,及肿瘤中可靶向诊治变异的检测。值得提防的是,将基于ctDNA的SCRUM-Japan GI-SCREEN磨真金不怕火与基于组织测序的GOZILA磨真金不怕火对比发现,ctDNA筛查显贵裁减了筛查时候,擢升了磨真金不怕火入组闭幕。
尽管ctDNA在精确肿瘤学中的哄骗日益粗莽,但系统对比ctDNA与肿瘤组织检测闭幕一致性的筹商仍较少,且ctDNA能否有用检测拷贝数变异的问题仍未明确。本筹商证实,69%的ERBB2扩增型结直肠癌患者,其ctDNA中可检测到ERBB2扩增,且ctDNA中的拷贝数与肿瘤组织检测闭幕强有关。但液体活检中ERBB2的检测闭幕,至少部分依赖于肿瘤负荷。本筹商中肿瘤组织样本为归档组织,非簇新活检样本,因此ctDNA与组织检测闭幕的不一致,部分原因可能是肿瘤的基因组进化。真谛的是,本筹商中ctDNA的检测聪惠度远低于HERACLES磨真金不怕火,该磨真金不怕火领受疏通的Guardant360检测平台,在29例HER2阳性结直肠癌患者的48份样本中,47份(97.9%)检测到ERBB2扩增,且校正后拷贝数≥25.82可估量患者从曲妥珠单抗蚁集拉帕替尼决策中获益。与其他基因组检测技巧一致,Guardant360检测平台也在不竭更新优化,这可能是两项筹商检测率存在互异的原因之一。此外,HERACLES磨真金不怕火的入组圭臬更为严格,条目HER2 IHC检测至少50%的肿瘤细胞呈3+染色,或HER2 IHC 2+且至少50%的肿瘤细胞中HER2:CEP17比值>2;而MyPathway磨真金不怕火仅条目肿瘤存在HER2扩增或过抒发。HERACLES磨真金不怕火的入组圭臬可能筛选出了扩增水平更高的患者,这亦然该筹商中ctDNA检测率更高的原因之一。
本筹商中系数患者的肿瘤组织检测均表现ERBB2扩增,因此未评估ctDNA检测的阳性估量值。但Nakamura等东说念主的筹商证实,不管是肿瘤组织已经ctDNA检测到ERBB2扩增的结直肠癌患者,接受P+T决策诊治均能赢得临床获益,领导ctDNA中检测到的ERBB2扩增是可靶向诊治的靶点。伙同本筹商闭幕可知,ctDNA中检测到ERBB2扩增的患者可领受靶向诊治,但ctDNA未检测到该扩增并不行排斥肿瘤组织中存在ERBB2扩增的可能。
通过ctDNA纵向监测已矣诊治早期疗效评估,是目下的筹商热门。尽管本筹商的部队样本量较小,但纳入了磨真金不怕火中出现诊治应酬和疾病发达的患者,具有一定的筹商上风。本筹商领受两种不同的分子学缓解评估圭臬,均证实P+T决策诊治可使患者赢得分子学缓解,且两种圭臬评估的分子学缓解均与患者PFS延迟有关。基于Zhang等东说念主筹商设置的Guardant360疗效评估算法,还识别出了ctDNA低水平的患者,其PFS和OS在数值上均更优,但因样本量较小未达到统计学兴致。往时仍需开展更多筹商,考据ctDNA分子学缓解监测在早期识别诊治应酬患者中的价值,及该监测技巧是否能为无应酬患者的诊治决策转变或蚁集诊治提供依据。
液体活检技巧日益熟练,可已矣更大基因panel的检测甚而全外显子测序,为肿瘤筹商和临床诊疗提供了便利。本筹商领受的Guardant360检测平台涵盖74个基因,可同期评估多种其他可靶向诊治的基因变异。因此,本筹商分析了基线样本中的共突变特征,以筛选潜在的诊疗养效和耐药性生物象征物。筹商发现,尽管检测到CDKN2A突变的患者数目较少,但该突变与患者接受P+T决策诊治后发生疾病发达显贵有关;CDKN2A突变与患者PFS和OS裁减显贵有关,KRAS突变与OS裁减显贵有关,PIK3CA和KRAS突变均与PFS裁减呈趋势性有关。由于本筹商仅纳入3例CDKN2A突变患者,该闭幕仍需更大样本量的筹商考据,但该发现具有一定的科学依据——既往筹商已证实,CDKN2A变异与患者接受FGFR扼制剂福巴替尼诊治的PFS裁减有关。此外,筹商者此前的肿瘤组织共突变筹商也证实,KRAS突变与患者客不雅缓解率和PFS编造显贵有关,PIK3CA突变也与PFS编造呈趋势性有关。上述筹商闭幕均为蚁集诊治决策的制定提供了参考依据。
液体活检的另一紧迫上风,是好像检测到可能为多克隆的赢得性耐药变异。本筹商纳入21例留存有疾病发达后样本的患者,其中8例患者的疾病发达发生在诊治8周内。21例患者中,20例在C1D1的ctDNA中检测到ERBB2扩增,18例在疾病发达时仍可检测到该扩增。值得提防的是,4例患者出现了既往血浆和组织检测均未发现的ERBB2突变,且均非曲妥珠单抗或帕妥珠单抗的伙同位点突变,但无法排斥这些突变通过变构效应干涉抗体伙同的可能。此外,2例患者出现致癌性ERBB2突变,领导小分子扼制剂蚁集诊治可能为该类患者提供新的诊治地方。
本筹商还发现了其他潜在的赢得性耐药机制:5例(23.8%)患者检测到MAPK通路变异(KRAS、NRAS、MAP2K1和BRAF),6例(28.6%)检测到PI3K通路变异(PTEN、TSC1、PI3KCA和MTOR),还有部分患者检测到其他酪氨酸受体激酶的变异。真谛的是,6例(28.6%)患者出现MET基因变异(包括4例MET扩增),既往筹商已证实MET扩增与患者对EGFR和HER2扼制剂产生耐药性有关。值得和蔼的是,3例MET扩增出目下早期疾病发达的患者中,领导该变异可能是对事先存在的耐药克隆进行筛选的闭幕;4例MET扩增患者中,2例既往接受过EGFR扼制剂诊治,领导该变异可能在既往诊治中产生。往时仍需开展更多筹商,考据MET扼制剂、KRAS扼制剂或AKT/mTOR扼制剂蚁集诊治,是否能为该类患者提供个体化的赢得性耐药处分决策。
本筹商存在诸多局限性:当先,筹商部队样本量较小,因ctDNA检测为磨真金不怕火后期新增筹商履行,仅纳入了MyPathway磨真金不怕火中HER2阳性结直肠癌部队半数的患者;但本筹商中患者接受的诊治决策具有抗肿瘤活性,且纳入了诊治应酬和无应酬的患者,好像已矣ctDNA检测闭幕与诊疗养效的联系分析。其次,患者入组依据的是归档肿瘤组织的检测闭幕,因此无法永别基因组进化与检测假阴性的情况。再次,本筹商领受的ctDNA检测面板基因数目较少,但该检测平台已得到充分考据。终末,仅7例部分缓解的患者留存有疾病发达后的液体活检样本,放胆了本筹商对赢得性耐药机制的探索。
综上,本筹商证实,约70%的ERBB2扩增型晚期结直肠癌患者,其ctDNA中可检测到ERBB2扩增,领导尽管大部分患者可通过ctDNA检测发现该扩增,但仍需伙同肿瘤组织检测,以识别系数ERBB2扩增的患者。ctDNA分子学缓解与患者更佳的PFS和OS有关,而ctDNA中的共突变特征为揭示结直肠癌对P+T决策的原发性和赢得性耐药机制提供了痕迹,也为蚁集诊治决策的制定指明了地方。
参考文件:
Meric-Bernstam, Funda et al. “ctDNA Analysis in ERBB2-Amplified Colorectal Cancer: Biomarker Analysis of the MyPathway Trial.” Clinical cancer research : an official journal of the American Association for Cancer Research vol. 31,14 (2025): 2935-2944. doi:10.1158/1078-0432.CCR-24-2763
发布于:江苏省热点资讯